复旦大学与上海交通大学，中国顶尖学府，学术水平与声誉皆高。

选择强基计划更佳的学校，需考虑学科评估、师资力量、科研成果与录取分数线等因素。复旦大学拥有5门A+学科，13门A-学科，6门A学科，上海交通大学则有6门A+学科，8门A-学科，11门A学科。从学科评估看，上海交通大学某些方面更胜一筹，整体差距不大，两者短期内有望接近。师资力量与科研成果对比，上海交通大学拥有57个硕士点，45个博士点，35名院士，22个重点实验室，而复旦大学则有43个硕士点，37个博士点，29名院士，26个重点实验室。在国家级特色专业上，复旦大学有15门，上海交通大学未具体提及。录取分数线方面，复旦大学在某些地区如贵州，普遍高于上海交通大学。在上海，考生倾向于复旦，因两者分数相近，但复旦录取人数更多，考生被录取机会更大。强基计划吸引力上，上海交通大学强基专业对考生更有吸引力。综合考量，两校在学科评估、师资力量与科研成果方面各有优势。复旦在录取分数线及考生选择上可能更有优势，尤其是在上海。而上海交通大学在部分学科评估及强基计划表现更突出。因此，哪所学校的强基计划更佳，取决于个人对专业、地理位置及录取机会的偏好。建议考生根据自身兴趣、职业规划与考试成绩，选择最适合自己学校的强基计划。