不会。在杭州萧山事业单位工作，农业户口还是非农户口没有任何关系，因为现在都是居民户口，不存在转成非农户口情况，因此户口性质不会改变。牵涉到提升、调动、档案、社保等问题，事业单位正式编制户口才需要进行要农转非户口转变。