二建过了两门第二年报名显示新考生无档案原因是：档案信息没有被及时录入到考试系统中、个人信息填写有误、档案信息已经被删除。

1、档案信息没有被及时录入到考试系统中：如果您是在上一年考试通过的两门科目，可能您的档案信息还没有被及时录入考试系统中，导致系统无法识别您的档案信息。这种情况可以联系当地教育考试中心或者二建考试机构，核实档案信息是否已经被录入。

2、个人信息填写有误：在报名时，如果填写的个人信息与原来的档案信息不符，也会导致系统无法识别您的档案信息。这种情况可以联系考试机构或者相关部门，核实您的个人信息是否填写正确。

3、档案信息已经被删除：在考试过程中，如果您的档案信息存在违规行为，可能会导致档案信息被删除。这种情况下，您需要联系考试机构或者相关部门，核实是否存在此情况。