一、不同的司法管辖区

1、东京都政府对都市警察有管辖权。

2、国家警察局对日本（东京除外）的县，县和地方警察具有管辖权。

二、不同的行政上司

1、警察局是最高级别，并在国家公安委员会的指导下。

2、警察局在行政上由东京都政府管辖。

三、制度属性不同

1、警察局是中央政府的警察局。

2、国家警察局是东京都警察局。

四、内部机构不同

1、东京都警察局设有几个专业部门和地区警察部门，包括总务部，警察局，生命安全部，刑事部，运输部，安全部和有组织犯罪对策部。

2、在公安部门内建立胶范及常驻派出所。

一、警察厅长官及次长

日本《警察法》第34条规定：“长官为警察官，警察厅次长、官房长、局长（情报通信局长除外。）及部长、管区警察局长等其他政令所定之职位皆为警察官身份，皇宫警察本部长为皇宫护卫官”。

警察厅首长为警察厅长官，由国家公安委员会经首相承认任免之。警察厅长官是全日本警察职员中最高之职位之警察官，也是《警察法》第62条规定之唯一阶级制度之外警察官。警察厅另设警察厅次长1人，阶级为警视监。厅长公务外出时，职务由次长代理。