一、如果先对账，然后再开票，按正常操作就行；

二、如果已开票，然后客户才确认扣款：

1、开负票，红冲收入；

2、客户会有正式的函件，确认扣款原因和金额，从费用列支。

客户扣款部分作为财务费用处理，但税费按开票金额计算和缴纳，原始单据至少要客户扣款的收据或扣款证明资料，实际收款单据。