我也是刚刚在一个小公司做java web开发，我的情况跟你的很相似，我也什么都不懂，基础不大好。有时候上面给的任务，自己一点头绪都没有的时候，便会觉得压力很大，不过我总是相信大部分问题是可以一步步解决的：

1. 不懂得就先google，百度下，实在是没有头绪的便问下老大以及老同事，不要怕问题多了就不好问，关键是你要理清头绪，知道自己要做什么，问题都是一步步解决的；

2. 你说基本的项目结构和代码都看不懂，那我觉得你应该多买几本大学本科的java web书籍看看，一切都从基础做起；

3. 既然你说公司想用你，那就说明了你不是很差，你要对自己有信心哦。

PS：我快工作半年了，现在进展比较顺利，一点都不会的就看基础教程，没有头绪的任务先问问提出需求的人+问问你的老大，你要相信自己哦。