多交契税可以通过向税务机关申请来退还。

当纳税人发现自己在缴纳契税时多交了税款，即实际支付的税款超过了应纳税额，可以在一定的时间范围内向税务机关申请退还多缴的契税。根据相关规定，这个时间范围通常是从纳税人自行结算缴纳税款之日起的三年内。在这个期限内，纳税人如果发现多缴税款，可以向税务机关提出退税申请，并要求退还多缴的契税及加算银行同期存款利息。

申请退还多交契税时，纳税人需要准备一系列相关的证明材料。这些材料通常包括：身份证原件及复印件、缴纳契税的税票原件及复印件、购房合同原件及复印件、销售不动产发票或购房款收据原件及复印件，以及退税申请人本人的银行卡复印件，并注明开户行网点名称及开户日期。此外，如果是因为房屋面积误差等原因导致多交契税，还需要提供房屋面积测绘图等相关证明材料。

提交退税申请后，税务机关会对纳税人提交的资料进行审核。审核过程中，税务机关会核实纳税人提供的材料是否真实有效，以及是否符合退税条件。如果审核通过，税务机关会出具退税凭证，并按照规定的程序将退税款项退还给纳税人。需要注意的是，退税的具体流程可能会因地区和税务机关的不同而有所差异，纳税人应当根据当地税务机关的规定和要求进行操作。

总之，多交契税的纳税人可以通过向税务机关申请来退还多缴的税款。在申请过程中，纳税人需要准备充分的证明材料，并按照当地税务机关的规定和要求进行操作。同时，也需要注意退税申请的时间限制，确保在规定的期限内提出申请。