1、首先工程承包方向相关税务部门提交施工项目相关建筑工程企业材料中的增值税的证明文件。2、其次承包方可以按照实际发生的材料增值税金额抵扣相应的应纳税额。3、最后税务部门会根据承包方的实际发生情况对其进行对账，保证抵扣的准确性，等待审核和确认即可。