永丰县国家税务局设有10个内设机构、1个直属单位以及3个派出机构，具体包括：

办公室：负责制定机关工作计划、日常政务处理、会议组织、文电处理、文书档案、信访、保密、政务信息、调研、政务外事、税收宣传、办公自动化、后勤服务的组织管理、接待、办公物品采购与管理、房产管理、职工医疗保健等。

监察室：负责单位纪律检查、行政监察、党风廉政建设、行业作风建设等工作。

人事教育股：负责执行人事管理制度、人事管理工作，如机构、编制、任免、调配、劳动工资、专业技术职务等，还负责本级领导干部的监督检查工作、离任审计计划、出国、出境政审、离退休干部管理、思想政治工作、精神文明建设、基层建设、干部学历教育、业务培训、机关党务、工会、青年、妇女工作以及机关工作秩序管理与目标管理考核。

收入核算股：负责税收计划编制、分配、税款入库、税收计划和统计工作、税收数据统计分析、税源调查、税收能力估算、税收负担分析、税收票证管理、财务、基本建设、物资装备、资产管理、内部财务审计、机关财务收支核算管理、大宗物品政府采购。

征收管理股：负责税收征管法律、法规和规章制度实施、税务登记、征管质量考核、纳税申报、纳税评估管理、税收征管资料管理、个体工商户、集贸市场、农村税收征管、纳税服务、纳税信用等级管理、普通发票管理、综合征管软件推广与应用、税务代理监管。

税政法规股：负责流转税及车辆购置税等税种政策、征收管理制度实施、增值税防伪税控推广管理、所得税政策与征收管理制度实施、城市商业银行、城乡信用社财务管理工作、涉外税收法律法规贯彻执行、反避税调查、跨国税务事项处理、进出口贸易税收管理、骗取出口退税防范、出口企业退税业务指导、税制改革与税收管理体制完善政策调研、税收法律、法规执行情况监督检查、重大税务案件审理、处罚听证、行政复议、应诉与赔偿、税法普及宣传、税收执法责任制考核与奖惩。

信息中心：负责信息数据分析与管理、信息系统建设与执行制度、计算机网络构建与管理、网络安全维护、信息设备、软件与数据库管理、“金税工程”网络畅通与数据管理技术、应用软件推广与技术培训、税控器具鉴定与推广工作。

办税服务厅：作为税务机关为纳税人提供涉税事宜办理与纳税服务的机构和场所，负责税务登记、纳税申报、税款征收与解缴、欠税公告、票证管理、税法宣传以及涉税申请受理。

税源管理科：负责城区及周边地区增值税一般纳税人、小规模纳税人、个体工商户与集贸市场的税务管理，承担纳税户税务登记与纳税申报的调查核实、税收预测分析、税收宣传、纳税辅导、税收调研、纳税服务、税源监控调查、定额核定、催报催缴、数据采集分析、发票核查、征管资料管理与漏征漏管理户清理。

纳税评估科：负责上级有关纳税评估工作制度及部署的贯彻落实、局内增值税一般纳税人与所得税重点企业的纳税评估、行业、区域或重点税源专项纳税评估、评估软件应用推广、纳税评估案例及相关材料报送、其他有关纳税评估工作。

稽查局：负责税务稽查规章制度实施、纳税评估发现的偷骗税案件查处、税务举报案件受理、上级交办与转办案件查处、司法协调工作、金税工程协查系统工作、税收专项检查牵头组织。

藤田分局、石马分局、沙溪分局：负责辖区内增值税一般纳税人与小规模纳税人税源管理与零散税款征收。