北京在日语中的写法是“北京(ペキン)”。

日语中的汉字大多来源于中文，但由于历史、文化和语言的演变，很多汉字的发音在日语中与中文有所不同。在日语中，“北京”的发音是“ペキン”，其中“北”读作“ペき”，“京”读作“ン”。这种发音上的差异反映了两种语言之间的独立发展。

此外，日语中还有假名系统，用于表示日语中的音节。对于“北京”这个词，日语中也会使用假名来表示其读音，即“ペキン”。假名系统包括平假名和片假名，其中平假名用于表示日语中的固有词汇和汉字词的读音，而片假名则主要用于表示外来语的读音。

值得注意的是，虽然“北京”在日语中的写法与中文相似，但由于发音和语境的不同，在日语中使用“北京”这个词时，所表达的含义和情感色彩可能与中文有所不同。因此，在跨语言交流时，了解不同语言之间的差异和特点是非常重要的。

总的来说，了解“北京”在日语中的写法和发音，有助于我们更好地进行中日文化交流和理解。同时，这也提醒我们在学习外语时，不仅要关注词汇和语法的学习，还要注重了解不同语言背后的文化和历史背景。