南京十三中国际部作为江苏省早期注册的国际高中，拥有丰富的课程选择和十九年的办学经验。学校提供中加OSSD安省高中课程班、中美高中AP课程班和中美艺术大师班，为学生提供双学籍和全球认可的双文凭机会。

在中加OSSD课程班，学生通过与加拿大邦德多伦多国际学院合作，获得全球认可的安省高中文凭，无需依赖标化考试，即可申请世界多国名校。课程特色包括“外教中辅”教学模式，生涯规划课程，以及AP选修课程，以及商理分班的灵活性。

中美AP课程班则引进美国康州公立高中课程，强调美高课程的权威认证和个性化学生管理。学生在丰富活动背景提升中，如FBLA商赛和物理竞赛中脱颖而出。而中美艺术大师班注重艺术基础与专业方向的探索和培养，从高一到高三提供全面的艺术课程和大学先修课程。

2022年，南京十三中国际部面向南京市初中毕业生招生，共计划招生100人，分两批次进行。招生代码和学费信息如下：中加班1108、1109（65人）、中美班1107、1104（35人），学费为58000元/年。