水利部、交通部或铁道部的监理工程师证书。

根据查询华律网显示：铁路工程监理工程师需要持有水利部、交通部或铁道部的监理工程师证书。这些证书需要通过全国统一考试，注册并取得相应资格。此外，也可以选择由监理协会颁发的注册监理工程师证书，不过这些证书需要进行培训和考试，难度相对较低。

铁路工程监理工程师是从事铁路建设监理工作的人，他们的主要职责是对铁路工程的施工过程进行监督、检查，确保工程质量和安全。