在设计施工总承包发票中，备注栏的填写应准确、清晰、完整地反映发票的基本信息。以下是应该备注中应该包含的内容：

1. 合同编号：在发票备注中注明合同编号，以便于查询和核对。

2. 项目名称：注明项目名称，以便于了解项目的具体内容。

3. 施工内容：简要描述施工的主要内容和范围，例如工程名称、施工地点、施工内容等。

4. 合同金额：在发票备注中注明合同金额，以便于财务部门进行核算。

5. 付款方式：注明付款方式，如预付款、进度款、结算款等，以便于相关部门了解项目的资金流向。

6. 付款期限：注明付款期限，以便于财务部门按时支付相关费用。

7. 发票开具日期：注明发票开具日期，以便于查询发票的有效性。

8. 发票单位：注明发票的开具单位，以便于确认发票的真实性。

9. 增值税税率和税额：注明增值税税率和税额，以便于计算项目的增值税负担。

10. 其他特殊备注：根据项目的实际情况，注明其他需要特别说明的事项，例如设计费用、施工图纸、施工队伍资质等。

发票的备注栏只提供了一些基本信息，并不包含具体的发票内容，所以需要在发票上明确列出发票的内容。在填写发票时，必须保证内容的准确性和真实性，否则可能会导致相关方的损失。在具体实施中，根据实际情况，还可以添加其他必要的备注信息。