助理全科医生培训基地由临床培养基地、基层实践基地和专业公共卫生机构组成，其建设在中国医师协会和省级卫生计生行政部门的共同推动下逐步完善。国家卫生计生委对基地进行动态管理和备案，确保培训质量。

临床培养基地以县级综合医院和中医临床培养基地以县级中医院为主，地市级综合性医院则作为补充。基层实践基地设于条件具备的乡镇卫生院、社区卫生服务中心和专业公共卫生机构。有关高等医学院校则承担综合素质和职业相关能力的培养课程。

建立不合格基地退出机制，动态管理基地，提高培训质量。国家支持与高职院校、本科高校联合培养助理全科医生，探索教育衔接，符合条件者可获得成人本科学历。鼓励“乡管村用”政策，对助理全科医生到村卫生室工作给予补助，吸引人才。符合条件的助理全科医生可申请参加全科专业住院医师规范化培训，根据临床实践能力，适当减少培训时间。取得《住院医师规范化培训合格证书》后，可提前一年参加全国卫生专业技术中级资格考试。