衢州职业技术学院提供多种专业的课程，涵盖理工科和文史科类。其中理工科包括药品经营与管理、机械制造与自动化、机电一体化技术、电气自动化技术、数控设备应用与维护、汽车检测与维修技术、汽车技术服务与营销、计算机应用技术、计算机网络技术、应用电子技术和光伏应用技术。而文史类则设有会计专业。

学院的专业设置旨在满足不同学生的学习需求，无论是对理工科感兴趣的学生，还是希望在文史领域有所发展的学生，都能找到适合自己的课程。

机械制造与自动化专业注重培养具备机械设计、制造、自动化控制等方面知识和技能的人才。机电一体化技术则更强调机械与电子技术的结合，培养学生在自动化设备设计、制造和维护方面的综合能力。

电气自动化技术专业致力于培养能够在电气工程领域从事设计、施工、运行和维护等工作的专业人才。数控设备应用与维护专业则主要面向机械加工行业，培养学生掌握数控机床操作与维护技术。

汽车检测与维修技术专业则针对汽车维修行业，培养学生具备汽车故障诊断与维修的能力。汽车技术服务与营销专业则注重培养汽车销售、客户服务及市场分析等方面的知识。

计算机应用技术和计算机网络技术专业则为信息技术领域输送技术人才，培养学生掌握计算机软件开发、网络管理与维护等技能。应用电子技术专业则侧重于电子产品的设计与制造。

光伏应用技术专业则主要面向新能源领域，培养学生掌握太阳能光伏系统的设计、安装和维护技术。会计专业则为学生提供财务会计、管理会计等相关课程，培养具备会计实务操作能力的专业人才。

学院的专业设置不仅涵盖了现代工业技术，还注重信息技术和新能源领域的最新发展，旨在为学生提供全面的知识和技能培养，以适应社会和市场的变化需求。