广东汕头自考专科全部考完后的申请毕业流程如下：

登录系统确认自己的姓名、性别、身份证号码、电子相片和各科成绩等数据，上述数据准确无误后方可申请毕业登记。

考生登录系统，按提示提交毕业申请。成功提交毕业申请后，须通过系统自行打印《广东省高等教育自学考试毕业生登记表》（以下简称“毕业生登记表”），并认真核对《毕业生登记表》正面的有关信息，如实填写背面的相关内容；同时，将该表交有关单位填写考生的思想品德表现及盖章。注意要求使用激光打印机、80g/㎡(或以上)A4复印纸、双面打印《毕业生登记表》，考生不得对该表的内容及格式作任何更改。

提交材料：身份证的原件（相关原件核验后即退还，下同）及复印件；《毕业生登记表》，社会考生一式两份，公开（开放）学院考生一式三份。

在规定时间内提交纸质资料（身份证原件及复印件，毕业登记表一式两份）等到自考办，提交资料时间是6月15-20日。

以上步骤仅供参考，具体流程可能因实际情况而有所不同，建议咨询相关工作人员。