工程缴税的计算方式主要包括营业税、城建税、教育费附加等多种税费，具体计算依据为工程收入及相关税率。

营业税是工程缴税的重要组成部分，其计算方式为按照工程收入的3%进行征收。这意味着，如果一个工程项目的总收入为100万元，那么需要缴纳的营业税就是3万元。营业税的征收标准是国家为了调节经济、组织财政收入而制定的，对于建筑行业来说，是必不可少的一项税费。

除了营业税外，城建税也是工程缴税中不可忽视的一部分。城建税的计算依据是营业税的税额，税率根据纳税人所在地的不同而有所区别，通常为7%、5%或1%。以营业税3万元为例，如果城建税税率为7%，那么需要缴纳的城建税就是2100元。城建税主要用于城市维护和建设，是保障城市基础设施正常运行的重要资金来源。

教育费附加则是按照营业税的3%进行征收的，其目的是为了支持国家教育事业的发展。继续以营业税3万元为例，需要缴纳的教育费附加就是900元。虽然教育费附加的税额相对较小，但它对于促进教育公平、提高国民素质具有重要意义。

此外，工程缴税还包括增值税、印花税等其他税费。增值税的计算方式较为复杂，一般按照销售额和税率进行计算；印花税则是在合同签订时按照合同金额的一定比例进行征收。这些税费的征收标准和计算方式可能因地区和行业而异，具体需要根据当地税务部门的规定进行操作。

总的来说，工程缴税的计算涉及多个税种和复杂的计算方式，需要纳税人仔细核对相关法规和规定，确保按照要求及时足额缴纳税款。同时，税务部门也应加强监管和服务，为纳税人提供更加便捷、高效的缴税服务。