建筑业在税务局发票分录问题上，通常遵循会计原则进行处理。对于发票金额的确认，通常是在工程完工并经过审计后的金额为准。

若企业在开具发票时，发现实际应开金额与发票开具金额存在差异，具体处理方式需根据实际情况而定。若为少开金额的情况，企业可以进行补开处理，以确保会计信息的准确性。

然而，若企业在开具发票时，不慎多开了金额，处理起来则较为麻烦。通常情况下，企业会面临开具红字发票的流程，以修正错误的会计记录。然而，这一过程不仅繁琐，还可能涉及税务风险。因此，在实际操作中，企业可能选择自行承担这一差额，以简化流程和减少税务困扰。

综上所述，建筑业在税务局发票分录的处理需遵循会计原则，并根据不同情况采取相应的补救措施。同时，企业在开具发票时应确保信息的准确性，避免因操作失误导致的额外成本与税务风险。