在工程预算报价中，利润的计算涉及多个部分。首先，直接费包括直接工程费和措施费，直接工程费由人工费、材料费和施工机械使用费构成，而措施费则涵盖了环境保护费、文明施工费等各项特定费用。间接费主要包括规费和企业管理费，规费涵盖工程排污费等社会保险费用，企业管理费则包括管理人员工资、办公费等日常运营成本。利润的计算通常基于计算基数，这个基数可以是直接费加上间接费，或者是人工费加上机械费，利润率则是企业在投标时根据市场情况自行确定的。

利润的计算公式为：利润=计算基数×利润率。而在税收方面，包括营业税、城市维护建设税和教育费附加，税率根据企业所在地区有所不同。企业管理费中的税金与预算报价中的税金内容不同，后者仅限于上述三项。

预算的制定方法有两种：定期预算和滚动预算。定期预算通常用于稳定行业，而滚动预算更适用于需求不稳定的行业，因为它能适应环境变化和不确定性因素，促使管理者持续考虑未来。

总的来说，工程预算报价中的利润计算既包含直接和间接成本，又受利润率和税收规定的影响，且预算的编制方法需根据企业的具体环境和行业特性来选择。