福州大学闽台合作项目的毕业证书与普通福大毕业证书之间存在显著差异。该项目并非本部的完全等同，其证书上的校名章和格式都不尽相同。从学术认可度来看，这种合作项目的毕业证书在某些人眼中可能被视为三本院校的低端选项，与211院校的证书相比，其含金量自然大打折扣。不仅如此，学位证书也会有所区别。

值得注意的是，持有这种项目毕业证书的人在求职或社会交往中，不应期待能凭借福大名义获得额外优势。档案信息是公开可查的，企图借此欺瞒单位是不诚信的行为，长远来看，这会对个人声誉产生负面影响。因此，对于那些希望借助名校头衔提升自身价值的人，是否选择投入额外费用入读这样的项目，值得深思。

如果不想走捷径，建议考虑回归正途，要么复读以争取进入更好的学校，要么在三本院校里努力学习，争取获得更高质量的学历。无论哪种选择，诚实地展示自己的教育背景和能力，才是长远发展的关键。