南通外国语学校面向全国招收学生。中学部每年级设4个班，小学部每年级设2个班，每班人数不超过40人。为实现因材施教，有效培养高素质人才的目标，入学新生需进行有关素质考查。

学校提供完善的生活、娱乐和保健设施，实行严格的科学管理和体贴入微的生活辅导，建立健全医务保健和心理辅导体系，对每一位学生的身心发展状况定期普测和个案分析，确保青少年学生健康成长。

中学部实行全寄宿制管理，生活上重视养成教育，在新的时代背景下提倡艰苦朴素。在生活指导老师的辅导下，提供给学生学习生活、学会生存的机会。小学部市区学生不寄宿，学校提供校车接送、午餐和午休铺位，低年级作业在学校完成，放学回家全由学生和家长支配课外学习和娱乐活动，既有利于孩子亲情发展、个性培养，又切实减轻了学生和双职工家长的负担。

学校鼓励勤学奋进、宏志苦读，设立奖励基金，对学业优秀的学生予以表彰和适当的奖金激励。连续两学年被评为“三好学生”，且诸门学业名列年级第一的品学兼优学生，还可获免费参加出国夏令营。