深圳火车站，位于罗湖区和平路，临近罗湖口岸，是广深铁路的起点，也是深圳地铁一号线的起点站，方便旅客前往香港。

深圳西站，又称为南头火车站，位于南山区学府西路，是平南铁路的车站，主要办理长途客运服务，新深圳站启用后，其长途客运服务将受到影响。

深圳北站，位于龙华新区，是新建的大型车站，称为新深圳站或深圳新客站，占地广阔，设有西广场和东广场，服务于广深铁路。

深圳东站，位于龙岗区布吉，原为普快、慢车站点，改造后与深圳火车站功能类似，承担部分中长途列车服务。

坪山火车站和福田站则专注于高铁列车的接发，分别服务于厦深高铁和京广深港客运专线。