主要有以下几种区别：

1、超市的桂圆（龙眼肉）作为食品、农产品一类进行购销管理，不谈药性，一般口感好就可以了。

2、在药店的话，桂圆作为饮片或食品销售也好，都是有厂家包装的，从原料入库到出成品，中间经过的环节涉及有检测（如微生物限度检测等）、包装生产等成本，还有在终端销售收取的上架费、促销费等等的加成，所以价格无法与超市的去比较。

3、不同消费者也不是都是以价格低为购买依据的，也会参考品牌、信誉、包装、便利等附加条件。以上都是指一般情况下的桂圆，在本质上没有太大的区别，是一个种。

4、桂圆肉国内的主要产区在广东（茂名、高州）和广西（博白地区），当然周边都有的，虽然种是一样，但是气候条件，加工方法也会形成不同的性状与口感。常见的桂圆加工方法有烘焙及生晒两种。国外的如泰国等也有货源进入国内。