在查询已开具的发票是否被认证抵扣时，您可以选择多种途径。首先，您可以直接前往当地的国家税务局进行查询，这种方式较为直接且可靠。其次，如果您有对方公司的税务登记号和网上报税密码，也可以登录国家税务局的官方网站，进入网上报税系统中的网上认证模块，这样可以查询到所有已认证的发票信息。值得注意的是，您还可以委托专业律师，他们可以代表您到受票企业的所在地国家税务局进行查询，以确保信息的准确性和安全性。

具体操作上，如果您决定亲自前往查询，建议准备好发票原件，并前往对方公司的国税分局大厅，由那里的工作人员帮您进行查询。这种方式虽然需要您亲自到场，但可以确保查询过程顺利，且能获得详细的查询结果。同时，使用网上报税系统的查询方式更为便捷高效，但需要您具备相应的网上操作技能和相关信息。

无论是通过网上系统查询还是到税务局现场查询，都需要您具备一定的基本信息，如发票号码、开票日期等。这些信息有助于快速定位发票，提高查询效率。此外，查询过程中，保持与税务部门的良好沟通，及时获取反馈，也是非常重要的。

在进行查询时，您还需要注意保护好自己的隐私和信息安全。不要随意将税务信息透露给他人，尤其是网上查询时，要确保使用安全的网络环境，避免信息泄露。同时，建议定期检查发票的抵扣情况，以便及时发现问题并采取相应措施。

总的来说，查询发票是否被认证抵扣是一个涉及多方信息核对的过程，既可以通过网络平台便捷操作，也可以通过实地查询确保准确性。选择适合自己的方式，合理利用各种资源，可以帮助您更好地管理和追踪发票信息。