密云县巨各庄中学的办学目标在于追求学生的全面发展，特别强调体育和科技创新教育。在过去的三年里，已有8名学生凭借优秀的体育成绩考入体育大学，他们在市级运动会中的表现令人瞩目。学校在科技创新领域也取得了显著成就，有80多人在全国无线电测向比赛中获奖，密云县唯一的一所全国科技测向一等奖示范校荣誉也落户于此。

学校配备了现代化的教学设施，每个专任教师都配备了工作电脑，拥有多功能的专用教室，如物理、化学、生物实验室，以及美术、音乐、劳技、史地、通用技术等教室，计算机教室和心理咨询室一应俱全。所有教室均配备了最新的设备，图书室藏书丰富，总量达到46000余册，为学生的学习提供了优良的物质环境。

为了激励学生全面发展，学校实施了奖学金制度，每年有20%的学生能获得优秀学生奖学金，对于品学兼优且家庭经济困难的学生，学校提供学费减免，并积极向上级申请助学金（我校学费为每学年700元，相比之下，城里高中的学费为每学年1600元）。

丰富多彩的校园生活也是学校的一大特色，2007年和2008年，学校分别成功举办了第一届和第二届艺术节，为学生提供了展示才艺的平台，丰富了校园文化生活。