根据国家相关规定及南通市会计档案管理办法，南通市会计档案的销毁周期被划分为不同的时间段。原始凭证、会计账簿等基础会计档案的销毁期限通常为5年。这一期限反映了这类档案的实用价值，超出这个期限，其记录的信息可能已不再具有重要的参考价值。而财务会计报表、财务决算材料等较为重要的会计档案，则需要在15年后才能考虑销毁。这类档案通常包含了企业在一定时期内的财务状况和经营成果，对于审计和未来的财务管理具有重要作用。对于财产清产核资档案、重要财务会计档案等核心会计档案，销毁期限则被设定为30年。这类档案通常涉及到企业的重大财务决策和经营活动，具有较高的法律效力，因此需要更长时间的保存。

对于存在争议的会计档案，其销毁期限则需要视具体情况而定。需要详细考虑档案的保留价值及其合法性。例如，如果某项档案记录了企业重大财务变动，其保存期限可能需要更长，以确保有足够的记录来支持相关财务决策或应对可能的法律纠纷。

在进行会计档案销毁前，必须进行备案和审批，确保所有流程符合相关规定。主管会计部门将负责监督和核准销毁工作，以确保档案的销毁过程严格按照规定执行，避免非法销毁或遗漏重要档案。销毁过程需要详细记录，确保每一环节都有迹可循，以保障档案安全。

总体而言，南通市会计档案的销毁期限是根据档案的重要性和实用性来设定的。通过合理安排销毁期限，既能有效节约存储空间，又能确保企业重要的财务记录得到妥善保存。