台州学院医学院建有设施先进的形态学实验室、显微镜互动实验室、机能学实验室、生化实验室、细胞分子生物学实验室、病原生物学与检验实验室、护理技能实验室、临床技能实验室、康复针灸推拿实验室等，实验室环境优雅、通风透光、宽敞舒适、干净卫生，适用于学生的学习和科研工作，是我院教学、科研和为社会服务的主要基地。

目前，800元以上的实验设备总值达1266万元，生均实验设备达9277元。

医学院拥有一家直属型三级乙等的附属市立医院，两家非直属型附属医院，即三级甲等的台州医院和三级乙等的台州市中心医院，同时还有复旦大学附属华山医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、浙江大学医学院附属浙一医院、附属浙二医院、附属邵逸夫医院、附属儿童医院、附属妇保医院、浙江省人民医院、浙江省立同德医院以及各市（地）级医院等40多家教学、实习医院。