在1911年11月6日（农历九月十六），广西省谘议局，由议长甘德蕃带领一百多名同盟会成员，以避免战火波及地方为由，向沈秉堃和平请愿，请求广西宣布独立。沈秉堃虽理解局势，但出于对清廷的责任，仅表示不轻举妄动，没有立即同意。

此时，掌握桂林巡防队实权的王芝祥，其地位得益于姐夫刘人熙的提携。革命党人试图通过刘人熙影响王芝祥，广西谘议局副议长黄宏宪等人也亲自与王芝祥面谈，劝说他支持独立。同盟会支部长耿毅甚至带着炸弹和短枪，提出“广西独立，新军北伐”的主张，这使得王芝祥有所动摇，但仍表示需与沈秉堃商议。

省谘议局与王芝祥说服沈秉堃后，决定以沈为都督，王芝祥和陆荣廷为副都督。11月7日（农历九月十七），桂林召开万人大会，沈发表独立演说并提出八项措施，得到民众热烈响应。随后，广西各地如柳州、庆远（现河池）、南宁相继宣布独立，实现了和平过渡。

尽管沈秉堃被推举为都督，但他以非广西人和与国民党无直接联系为由，借口援鄂而离开。王芝祥接替沈的职位，但因其在清末的镇压记录，使得他心存不安，不愿继续担任，编巡防军为六个大队后，也以北上援鄂为名离开。陆荣廷，作为提督和旧军中的有力人物，因其“桂人治桂”的主张以及党人和同僚的支持，成为继任都督的热门人选。