厦门有许多知名的高等教育机构，其中包括：

厦门大学

厦门大学（Xiamen University），简称“厦大”，是中华人民共和国教育部直属的综合性全国重点大学，是国家“211工程”、“985工程”重点建设高校之一。它是中国近代教育史上第一所华侨创办的大学，也是中国最早开展研究生教育和学位授予的单位之一。

集美大学

集美大学（Jimei University）位于福建省厦门市，是福建省重点建设的公立大学。学校以航海教育和水产教育为特色，拥有多个与海洋相关的学院和专业。

厦门理工学院

厦门理工学院（Xiamen University of Technology）是一所具有硕士学位授予权的省属公立本科大学。学校设有工学、理学、文学、经济学、管理学、艺术学等学科门类，致力于培养应用型高级专门人才。

厦门医学院

厦门医学院（Xiamen Medical College）是福建省三所医学本科高校之一，主要培养医学类应用型专业人才。学校设有临床医学、护理学、口腔医学等多个本科专业。

厦门城市职业学院

厦门城市职业学院（Xiamen City University）是由厦门市人民政府举办的一所全日制公办高等职业院校。学院设有财经、信息、工程技术、艺术设计传媒、教育与民生等多个系部，提供多种高职专业教育。

厦门华厦学院

厦门华厦学院（Xiamen Huaxia University）是经教育部批准设立的本科层次的独立学院，由厦门华厦教育集团投资创办。学校设有经济管理学院、人文学院、信息与机电工程学院、建筑与土木工程学院等院系，涵盖文、理、工、经、管、艺等多学科。

厦门工学院

厦门工学院（Xiamen Institute of Technology）是福建省教育厅主管的全日制普通本科高校。学校设有机械与材料学院、电子与电气工程学院、建筑与土木工程学院、计算机与人工智能学院等院系，提供多个工科专业教育。

厦门软件职业技术学院

厦门软件职业技术学院（Xiamen Software Vocational Technical College）是经福建省人民政府批准、教育部备案的全日制普通高等院校。学院以软件技术、数字媒体技术、电子商务等专业为特色，致力于培养IT行业的高技能人才。

厦门海洋职业技术学院

厦门海洋职业技术学院（Xiamen Ocean Vocational Technical College）是福建省教育厅主管的全日制公办高等职业院校。学院以海洋类专业为特色，设有航海技术、轮机工程、船舶电子电气工程等专业，为海洋经济发展培养专业技术人才。

厦门演艺职业学院

厦门演艺职业学院（Xiamen Performing Arts Vocational College）是经福建省人民政府批准、教育部备案的全日制普通高等院校。学院以表演艺术、音乐表演、舞蹈表演等专业为特色，致力于培养文化艺术领域的专业人才。