吉林大学数学系基础数学专业以泛函、代数、拓扑三个教研室为核心，成立于1952年。该专业由一群杰出数学家如王湘浩院士、江泽坚教授、徐利治教授及谢邦杰教授等创立，是首批成立的数学专业之一。几代数学家秉承严谨学风，致力于数学研究与教育，为国家输送大量优秀数学人才，承担国家级科研项目，产出国内外有影响力的教学科研成果，并屡获国家级、省部级以上奖励。这使得吉林大学基础数学在国内产生重要影响。基础数学于1981年成为首批博士点，1988年被认定为国家重点学科。现有26名教师，其中7名教授，5名副教授，5名博士生导师，13名具有博士学位。主要研究方向包括泛函分析、代数学、拓扑学，由江泽坚教授、谢邦杰教授、孙以丰教授指导。泛函分析领域涉及算子代数、算子理论、函数论、复几何等，现有2名博士研究生，8名硕士研究生。代数学领域涵盖环论、交换环论、线性代数、计算代数、多项式自同构、编码与密码的代数理论等，拥有6名博士研究生，4名硕士研究生。拓扑学领域研究拓扑、拓扑动力系统、遍历理论、分形几何、集值分析等，现有7名博士研究生，3名硕士研究生。基础数学系与应用数学系共同负责“数学与应用数学”专业本科生的教学与学科建设。数学系开设课程包括《高等代数》、《代数与几何》、《解析几何》、《实变函数》、《复变函数》、《泛函分析》、《抽象代数》、《拓扑学》以及《微分几何》等。