北京大学校园占地总面积约7000亩，遍布六个校区：燕园校区、医学部校区、昌平校区、大兴校区、无锡校销慎携区和深圳研究生院校区。其中，燕园校区作为本部，占地面积1.95平方公里（合2925亩）。

自1949年底，北大教育系并入后，1952年经历了一次仿照苏联高等院校的院系调整。这次调整使得北大、清华、燕大三校的自然科学和社会科学领域的知名学者汇聚一堂，为北京大学在文理两科的长期领先地位奠定了基础。1955年，为了迅速建立中国自己的体系，北大创建了全国首个人才培养基地——物理研究室（后成为技术物理系的前身）。1979年，力学系成立；1982年，社会学系成立；1983年，考古学专业从历史学系分离，独立建立考古系，同年还成立了由教授担任所长的计算机科学技术研究所。

到了2000年4月3日，北京大学与北京医科大学合并，共同组建了新的北京大学。