南京师范大学拥有三个校区，分别是仙林校区、紫金校区和随园校区。仙林校区作为主校区，位于仙林大学城，是普通本科生（除了动院和电自院的学生）和研究生一年级的所在地。该校区设施完善，图书馆设施完备，宿舍条件也很不错，交通便利，附近有70路公交车可以直达丹凤街，97路则可以通达火车站。

紫金校区位于板仓路，占地面积不到300亩，主要服务于自考生以及动院和电自院的普通类本科生。这里环境相对安静，设施较为基础，但适合需要安静学习氛围的学生。

随园校区是南京师范大学的老校区，位于市区内，环境优雅，建筑富有古韵，是研二和研三学生的主校区。占地约300亩，绿化率很高，非常适合喜欢安静和自然环境的学生。整体而言，仙林校区因其设施完善和便利的交通而被认为是最好的选择。