甲醇在染色过程中起到关键作用，它促使瑞氏染料中的美蓝（M）与伊红（E）在溶液中离解，从而使得细胞成分能够选择性地吸附染色液中的有色物质，实现着色。在瑞氏染液中，美蓝如放置过久，可能会氧化并含有天青，这种天青与美蓝及伊红形成的化合物能够使细胞核染成紫红色，但不会使胞浆呈现蓝色。多余的美蓝则可以染色胞浆为蓝色。染色过程主要是化学反应，实质上是离子之间的结合反应。伊红的负离子与美蓝的正离子作用后，会生成中性的伊红化美蓝，经过长时间放置后，这种化合物可能会因氧化而含有天青。

具体来说，染色过程中的化学作用是通过染料与细胞内特定离子（如NH3+和COO-等）的结合来实现的，这使得细胞核和胞浆能够分别染成不同的颜色。细菌会呈现蓝色，而组织细胞的胞浆则为红色，细胞核则为蓝色。

在这一过程中，美蓝和伊红的相互作用至关重要。美蓝能够与细胞核中的NH3+离子结合，使细胞核染成蓝色；而伊红则能够与胞浆中的COO-离子结合，使胞浆染成红色。此外，天青的存在也会影响染色效果，它与美蓝和伊红结合后，会进一步改变染色的颜色和强度。

染色过程中的化学反应是动态的，染料与细胞内离子的结合和解离在不断进行。因此，染色结果会受到染色时间、染液成分以及细胞本身的特性等多种因素的影响。通过精确控制这些条件，可以实现对细胞结构的准确染色，从而为细胞学研究提供重要支持。

值得注意的是，染色效果的好坏不仅取决于染色技术，还与染料的质量和使用方法密切相关。为了获得最佳的染色效果，需要严格按照染色操作规程进行，确保染色液的新鲜和纯净。