菏泽市国家税务局作为本地区的税收管理核心机构，遵循国家税收法律和规章，实施垂直领导，其行政级别与地方政府部门相当。首要任务是:

一、执行国家税收政策，研究并制定地方实施细节，确保法律法规的有效贯彻。

二、结合经济发展策略，制定本系统的税收发展规划和年度计划，并负责实施，通过税收调控经济，推动经济发展。

三、根据经济状况和上级下达的税收指标，制定税收收入计划，确保税收任务的完成，并监控经济活动。

四、负责中央税、中央地方共享税的征收与稽查工作，管理增值税专用发票、普通发票及税收票证。

五、确保税务执法的合规性，处理税务行政处罚、听证、复议和诉讼事务，保障法律执行的公正性。

六、负责进出口税收和涉外税收的管理工作，维护国家税收权益。

七、承担税收会计、统计工作，确保财务信息的准确性和完整性。

八、负责系统内的财务、审计、建设、采购和资产管理，确保资源的有效利用。

九、进行机构设置、编制管理和人事工作，管理下级税务局的领导班子。

十、负责思想政治、精神文明、基层建设和教育培训的管理工作，提升队伍素质。

十一、落实纪检、监察工作，确保内部监督机制的健全。

十二、推动税收科研与学术交流，鼓励科研成果的应用和奖励。

十三、规划和实施税收信息化，建设和管理税收信息系统，提高工作效率。

十四、解读税收政策，分析税收动态，组织税法宣传，提升公众税收意识。

十五、监管税务代理行业，维护市场秩序。

十六、最后，完成山东省国家税务局和地方党委、政府分配的其他相关任务。