细菌的基本结构包括细胞壁、细胞膜、细胞质与核质体，而特殊结构则有荚膜、鞭毛、菌毛和芽孢，它们在细菌的生存和功能中扮演着重要角色。

首先，细胞壁是细菌的保护屏障，它不仅赋予细菌一定的机械强度，抵抗外界压力，还参与细胞间的相互作用和防止大分子入侵。细胞膜则是细菌的薄层外壳，对细菌的生理过程，如呼吸和光合作用，起着关键作用。革兰阴性菌的细胞外膜为其提供了额外的保护层。

细胞质与核质体是细菌的核心区域，细菌没有核膜，DNA直接位于核质体中，这种独特的结构使得细菌的基因表达过程高度同步。细菌的特殊结构如荚膜，不仅保护细菌免受环境伤害，还帮助其粘附宿主细胞，进行定向感染。

鞭毛则是细菌的运动器官，通过改变鞭毛蛋白的旋转方向，细菌可以调整其运动状态。菌毛则分为普通菌毛和性菌毛，前者参与吸附和侵染，后者则是遗传物质传递的媒介。

在极端条件下，细菌会形成芽孢，这是一种具有强抵抗力的休眠体，能在不利环境中生存。细菌根据形态、生活方式和氧气需求，被分类为球菌、杆菌、螺旋菌等，有的是自养菌，有的是异养菌，有的需要特定的氧气条件。

总的来说，细菌的这些结构和特殊结构，使得它们在生态系统中扮演着多样的角色，既是疾病的病原体，也是有益的生物，如在食品工业和废水处理中发挥重要作用。了解这些基本结构有助于我们更好地理解细菌的行为和应用。