市知识产权局，即市专利管理局，为正科级全额拨款事业单位。其主要职责包括负责全市专利工作和统筹协调涉外知识产权事项等。

赣南山区开发办公室为正科级全额拨款事业单位。其主要职责为策应全省实施鄱阳湖生态经济区建设发展战略，负责我市赣江源头生态经济建设中相关科技计划的研究、制定，组织、指导相关科技项目的实施，承办省山江湖开发治理办公室交办的事项。

赣南生产力促进中心，也被称作赣州市科技咨询服务中心，为正科级自收自支事业单位。其主要职责是负责整合社会科技资源，为中小企业提供技术信息、技术咨询、技术转让、科技投（融）资、科技产权交易等服务工作。

市科技培训服务中心为正科级自收自支事业单位。其主要职责包括负责全市科技干部、技术人才的培训和技术、人才引进等科技服务工作。