三本医科大学包括：

1. 吉林大学医学院；

2. 北京大学医学部；

3. 重庆医科大学；

4. 南京医科大学。

解释如下：

吉林大学医学院是中国知名的高等医学院校之一，其教学质量和科研水平都得到了社会的广泛认可。北京大学医学部作为国内外有较高声誉的医学教育机构，培养了大批优秀的医学人才。重庆医科大学在国内医学领域具有较高的知名度，其临床医学、药学等专业颇受好评。南京医科大学在医学教育、科研及医疗服务方面都有突出的表现，得到了社会的广泛认可。

以上这些三本医科大学都有着良好的教学环境和师资力量，为学生提供了优质的医学教育资源。这些学校注重理论与实践相结合的教学方式，培养学生的临床技能和医学素养，为我国的医疗卫生事业做出了重要贡献。