医学学硕西医综合考试有两门主要科目，306和699，它们之间的区别在于考试内容和适用范围。306是临床医学综合能力（西医）的科目，主要考核临床医学的基本知识、基本理论与基本技能，面向临床医学硕士专业学位的考生。而699则是医学综合（西医）科目，内容涉及基础医学与临床医学等多个学科领域，适合报考除临床医学硕士专业学位之外的其他医学硕士专业学位的考生。建议考生访问相关医学考试官方网站或咨询医学专业人士以获取更精确的信息。