杀灭细菌芽孢的有效方法大多数是高压蒸汽灭菌法，这是最常用到的，也是比较有效的一种方式。

细菌芽孢是一种会致病的微生物，也是一种抗逆性最强的生命体，在杀灭的时候会有一定困难，最主要的杀灭方式是选择高温蒸汽，是将食物加热后才可以杀灭的一种病原微生物，温度有可能达到120度左右的时候，才可以把芽孢菌杀灭掉，食品也才能长期的保存。

细菌芽孢但没有被完全杀灭的情况下是不可以长期保存的，很可能会出现大量繁殖，也会导致食品容易腐败和变质，吃了之后会引起不良的症状。