山东水利职业学院的专业设置涵盖了多个领域，包括水利工程、资源与环境、机电工程和信息工程等。水利工程系下的专业包括水利工程、水利水电工程管理、水利水电建筑工程等。这些专业的课程旨在培养学生的水利与水力资源开发、管理及维护的专业能力。另外，还有工程测量技术、地籍测绘与土地管理、道路桥梁工程技术、高速铁道工程技术、城市轨道交通工程技术等专业，为学生提供了多样化的选择。

在建筑工程技术、土木工程检测技术、建筑装饰工程技术、建设工程监理、建设工程管理等方面，学院也设置了相应的专业课程，以满足市场对建筑领域人才的需求。这些专业的学习内容包括建筑结构、施工管理、建筑材料及检测技术等。

机电工程系的专业设置较为多元，包括机电一体化技术、数控技术、无人机应用技术等。这些专业的课程涵盖了机械设计与制造、制冷与空调技术、模具设计与制造、机电设备维修与管理等内容，为学生提供了丰富的实践机会。

信息工程系则专注于培养学生的计算机与信息技术能力，包括计算机网络技术、软件技术、大数据技术等专业。这些专业的学习内容涵盖了编程语言、数据库管理、网络安全等。