福州医药类大学排名前列的两所院校分别是福建医科大学与福建中医药大学。具体排名如下：

福建医科大学，位于福州市，是福建省一流大学和一流学科建设高校，同时被福建省重点建设，是教育部“卓越医生教育培养计划”项目试点高校。该校以卫生人才培养、医学科学研究与医疗卫生服务为重心，是福建省医学教育的中心。

福建医科大学的前身始于1937年，由福建省立医学专科学校创立，历经改名与合并后，于1996年正式定名为福建医科大学。2003年，学校被列为福建省重点建设高校，并顺利通过教育部本科教学工作水平评估。

福建中医药大学，位于福州市，也是福建省一流大学和一流学科建设高校，福建省重点建设高校。该大学是国家“卓越医生（中医）教育培养计划”改革试点高校，获得教育部本科教学工作水平评估优秀评价，并实施国家级大学生创新创业训练计划项目。

福建中医药大学创建于1958年8月，原名福建中医学院，是中国内地早期的高等中医药院校之一。2010年3月，学校更名为福建中医药大学。