办公室，产权登记一室，产权登记二室，抵押登记室，信息管理室。根据查询北海市人民政府官网得知，北海市不动产登记中心为北海市自然资源局下属相当副处级财政全额拨款事业单位，内设5个机构，分别为办公室、产权登记一室、产权登记二室、抵押登记室、信息管理室。