包括细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生动物、显微藻类等在内的一大类生物群体

它个体微小，样貌千奇百怪。肉眼看不清。除真菌。

也有如此分类：

分类

原核类:三菌,三体。

三菌：细菌、蓝细菌、放线菌 三体：支原体、衣原体、立克次氏体

真核类: 真菌,原生动物,显微藻类。

非细胞类: 病毒,亚病毒 ( 类病毒,拟病毒,朊病毒)。

微生物对人类最重要的影响之一是导致传染病的流行。在人类疾病中有50％是由病毒引起。世界卫生组织公布资料显示：传染病的发病率和病死率在所有疾病中占据第一位。

微生物千姿百态，有些是腐败性的，即引起食品气味和组织结构发生不良变化。当然有些微生物是有益的，它们可用来生产如奶酪，面包，泡菜，啤酒和葡萄酒。

微生物能够致病，能够造成食品、布匹、皮革等发霉腐烂，但微生物也有有益的一面。最早是弗莱明从青霉菌抑制其它细菌的生长中发现了青霉素，这对医药界来讲是一个划时代的发现。后来大量的抗生素从放线菌等的代谢产物中筛选出来。抗生素的使用在第二次世界大战中挽救了无数人的生命。