外购货物的合理损耗和其他毁损、短缺在会计处理上有明显区别，理解这些差异对于决策者获取准确的会计信息至关重要。

合理损耗，作为企业生产经营中不可避免的损失，被视为正常成本的一部分，应计入存货成本中。根据《企业会计准则——存货》规定，存货成本包括采购成本、加工成本和其他成本，运输途中的合理损耗被视为直接归属于存货采购的费用，成为采购成本的一部分。

对于除合理损耗外的其他毁损、短缺，则需要根据情况分别处理。如果能从供应单位、外部运输机构等收回物资短缺或其他赔款，则应冲减物资的采购成本。对于因意外灾害发生的损失或尚未查明原因的途中损耗，则暂作为待处理财产损溢处理，不得增加物资采购成本。

举例说明，某增值税一般纳税企业购入一批商品，进货价格为80万元，增值税进项税额为13.6万元。商品到达后验收发现短缺30%，其中合理损耗5%，另有25%的短缺尚待查明原因。按照合理损耗应计入存货成本的原则，以及进项税额可以抵扣的规定，企业应进行如下会计处理：

借：库存商品600000元（80×75%）

应交税金——应交增值税（进项税额）136000元（80×17%）

待处理财产损溢234000元[800000×25%×（1+17%）]

贷：应付账款93600元

应交税金——应交增值税（进项税额转出）34000元（80×25%×17%）

在计划成本法下，合理损耗同样计入存货成本，但还需计算“材料成本差异”。对于其他毁损、短缺，则不计入存货成本，亦不能计算“材料成本差异”。

再以某单位外购材料为例，购入100公斤，计划单价10元/公斤，实际单价12元/公斤；入库时发现短缺20公斤，其中12公斤属于合理损耗，8公斤属于合理途耗外的毁损。计算材料成本差异如下：

计划成本=80公斤×10元/公斤=800元

实际成本=（80公斤+12公斤）×12元/公斤=1104元

材料成本差异=1104元-800元=304元

这些成本差异将在未来80公斤材料上进行分配。对于非合理损耗部分，应计入管理费用，计算为8公斤×12元/公斤=96元。