玉溪市食品药品监督管理局的内设科室和各自的主要职责如下：

1. 办公室：负责全局日常政务协调，包括会议组织、文电处理、机要保密、档案管理、信息宣传、信访保卫等工作。同时，负责政务督办、综合性报告起草、机关基建、装备管理以及行政后勤事务。

2. 人事教育科：负责系统的机构编制、干部管理和人事劳资工作，制定教育培训规划，负责药学技术人员职称晋升和执业药师考试注册相关协助工作。

3. 财务统计科：负责财务及资金管理，制定基建、装备和财务计划，编制预算和决算，管理行政收费及罚没收入，监督县区局及直属单位的财务管理，进行统计资料收集和上报。

4. 政策法规科：负责起草食品、保健品和化妆品安全管理规定，执行药品和医疗器械监管法律，监督执法行为，组织法制宣传教育和行政案件审核等工作。

5. 食品安全协调与监察科：制定食品安全规划并监督实施，综合协调食品安全监督和检测，发布安全信息，组织宣传教育，处理安全事故，负责专项执法和应急救援。

6. 药品安监、注册与医疗器械科：实施药品管理制度，监管药品生产、中药材生产、医疗机构制剂等质量管理，监督医疗器械产品和使用，查处假劣产品，发布医疗器械质量公报。

7. 药品市场监管科：监督药品流通法规，实施药品零售企业资格认定，负责药品经营质量管理，监督药品质量，查处违法行为，发布药品质量公报，审核药品广告。

8. 纪检监察室：负责全局纪检监察工作，查处违法违纪行为，受理举报，制定党风廉政建设规划，监督执行党风廉政建设和依法行政工作，负责党群工作。