现在允许抵扣的发票主要分为两类。

第一类为增值税专用发票，其税率包括17%、13%、3%和6%四种。其中，一般纳税人简易征收的需经特殊批准。

第二类为特定运输业的发票，包括铁路运输、航空运输、管道运输、海洋运输、公路运输、内河运输以及联运发票。这些发票均采用电脑打印形式。

增值税专用发票和特定运输业的发票是允许抵扣的主要发票类型。对于企业而言，合理利用这些发票进行抵扣可以有效降低税收成本，提高经济效益。