岳阳市地方税务局内设行政科（室）共12个，均为正科级单位，具体负责不同税种和费（金）的征收管理工作，以及税务系统的行政事务、政策法规、信息化建设、纳税服务等职能。

办公室负责协调机关日常政务工作，承担面向社会的税收宣传、新闻发布及政务公开工作，并管理其他行政事务。

政策法规科制定全市依法行政、依法治税方案，负责涉税规范性文件管理工作，监督税收法律、法规、规章的执行情况。

流转税科和国际税收管理科负责营业税、烟叶税、货物运输税收、国际税务等管理工作，进行纳税评估、税源管理，指导纳税辅导、咨询服务。

财产和行为税科、所得税科分别负责城市维护建设税、土地增值税、房产税、车船税等税种，以及企业所得税和个人所得税的征收管理工作。

规费科负责社会保险费、文化事业建设费等费（金）的征收（代征、代收）管理及费改税工作，进行纳费评估、费源管理。

征管和科技发展科（发票管理所）负责税收征管法律法规、部门规章及规范性文件的落实，税收管理信息化建设，以及个体税收的征收管理。

纳税服务科组织协调各税种的纳税服务工作，提供纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等服务。

收入规划核算科编制税收收入中长期规划和年度计划，进行税收收入分析预测，组织落实税收会计核算、统计核算、税收票证管理等相关制度。

财务管理科负责税务经费、装备和资产管理，编报审核系统的财务预、决算，办理各项经费的拨付，承担系统政府采购工作。

人事教育科拟订系统干部人事制度、税务人才队伍建设和人员教育培训规划，承担干部任免、考核和县、市、区局领导班子管理工作。

思想政治工作科（机关党委）负责系统干部人事、工资、机构编制和公务员管理工作，承担有关外事工作，并管理离退休人员。