莆田有莆田学院和湄洲湾职业技术学院。

莆田学院于2002年创办，是一所公立的全日制普通本科高校。学校设有56个本科专业，其中医疗专业较为热门，这个专业的毕业生就业机会比较多。莆田学院的专业学位授权点(硕士点)有3个，有17个二级学院。学科专业涵盖了理学、工学、管理学、医学、教育学、艺术学和经济学等8大类。

湄洲湾职业技术学院是一所理工类的公办专科学校，创立时间为1985年，学院设有二级学院9个，高职专业40个。而且在2014年获得国家教学成果奖二等奖。