1. 账务处理模块

该模块以会计凭证为原始数据，依据会计科目进行记录、分类、计算、加工和汇总。它的功能包括账务初始化（建账）、凭证处理（包括输入、审核和汇总）、查询、对账、结账、打印输出以及其他辅助功能。

2. 报表处理模块

报表处理模块根据国家统一的会计制度，利用会计资料编制会计报表，以供公司管理者及政府部门参考。报表可分为个别报表、汇总报表和合并报表。模块功能包括报表定义、报表计算、报表汇总、报表查询、报表输出。

3. 固定资产核算模块

此模块专注于固定资产的明细核算和管理。功能包括建立固定资产卡片、账簿、录入变动情况、计提折旧、汇总计算、查询及打印输出、编制转账凭证。

4. 工资核算模块

工资核算模块以职工个人工资的原始数据为基础，计算和处理工资。功能包括设计工资项目及计算公式、录入工资基础资料、增减变动修改、计算汇总、查询、打印输出。

5. 其他模块

这些模块包括存货核算、成本核算系统、应收应付款核算、销售核算和财务分析等。根据行业特点，还有零售业进销存核算系统、批发业进销存核算系统等。为满足管理需求，也有劳资人事管理系统、国有资产管理系统等。