水电六局南方公司项目部都有八大部门。中国水利水电南方公司是中国水利水电第七工程局有限公司在区域化发展战略下成立的首个区域分公司。公司设置职能部门有办公室、市场开发部、工程项目管理中心、安全环保管理部、财务部、人力资源部、党群工作部、审计与风险管理部，共计八个部门。